唇腭裂的病因临床上尚未完全阐明，但大致可分为遗传因素、营养因素和生物因素。唇腭裂是指以上唇裂、伴或不伴牙槽嵴裂、腭裂为特征的先天性畸形。临床上通常采用手术修复。

1、遗传因素：先天性唇腭裂患儿一般有染色体异常、单基因病和多基因病。同时，当父母或其他直系亲属有唇腭裂患者时，胎儿患此病的风险也较高。会增加；

2、营养因素：维生素A缺乏或过量都会导致唇裂、腭裂的发病率增加。因此，怀孕期间如果因呕吐、厌食或偏食而缺乏维生素A，就可能引起唇腭裂；

3、生物因素：临床上已知风疹病毒、疱疹病毒、乙型肝炎病毒等病毒可致畸。风疹病毒与唇裂和腭裂密切相关。病毒从母体通过胎盘进入胚胎，引起胚胎血管结构异常，导致胚胎发育异常，可导致唇裂和腭裂畸形。